被推薦者は、2025年5月より後、2027年8月より前に博士号の要件を満たすこと。研究分野は数学、計算機科学と情報科学、生命科学、物理科学と工学のいずれか。「A Junior Fellowship cannot be held concurrently with another fellowship or a tenure-track faculty appointment.」と定められ、他のフェローシップやテニュアトラックの教員職との兼務はできない。「Junior Fellows are expected to be in residence in New York City during the academic year.」とあり、学年度中はニューヨーク市内に居住する必要がある（学期外の居住は不要）。受入機関はニューヨーク市内の教育機関で、ポスドク研究員の身分を与え教育義務を課さないこと。Flatiron Institute は受入機関になれない。推薦者は教育機関または研究機関で終身在職権相当の職にあり、年に1件しか推薦できず、自身を推薦することも被推薦者のメンターになることもできない。推薦状のもう1名の書き手はテニュアトラックまたは終身在職権の職にあり、被推薦者本人やそのメンターであってはならない。推薦者と推薦状の書き手のうち少なくとも一方は被推薦者の現所属機関の外部であること。メンターはニューヨーク市内の受入機関でテニュアトラックまたは終身在職権の職にあり、同時に1名のジュニアフェローしか指導できず、推薦状や推薦書を書くことはできない。国籍や現在の居住国による制限は公式ページに記載がないが、居住国に関する明文の記載がないため事務局への確認を推奨する。
統括者は「a tenured faculty, or equivalent, position at an educational institution with a Ph.D. program in the director's department at the time of application and for the duration of the award」を満たすこと。PIとco-Iは応募時から助成期間を通じて、教育機関で終身在職権を有するかテニュアトラックの教員（またはこれに相当する職）であること。学科・分野の制限はない。統括者、PI、co-I、その他の参加者は米国外の機関に所属していてもよい。co-Iは、PIの所属機関か、コンソーシアム契約でプロジェクトに参加する他の組織に雇用または所属していること。応募機関は、米国内外の公私立の教育機関および独立した研究センター。米国の国立研究所への資金提供およびそこに雇用される研究者への給与支援は不可（無給のメンバーとしての参加は可）。営利企業も助成対象外。PI・Additional PI・co-Iとして関われるのは最大2件のLOIと1件の本提案まで。現在助成中の共同研究のPI・Additional PI・co-I・統括者は、無償延長期間中を含め、新たなLOIや提案に参加できない。中国（香港を含む）の機関には資金提供を行わない。サイモンズ財団（Flatiron Instituteを含む）からW-2を受け取る職員はPIとして応募できない。
Principal Investigators (PIs) and other project participants may be from both U.S. and non-U.S. institutions, with the exception for institutions in China as noted below. 1提案あたりPIは最大3名（Applicant PI 1名＋Additional PI 最大2名）。大学に所属するPIは、応募時から助成期間を通じて博士課程を持つ学科で終身在職権を有するかテニュアトラックの教員（またはこれに相当する職）であること。国立研究所や非学術機関に所属するPIは、博士号を有する常勤・非訪問の研究職またはシニアサイエンティスト（またはこれに相当する職員）であること。Applicant PIまたはAdditional PIとして関われるのは最大2件のLOI・2件の提案までで、資金を受けられるのは1件のみ。米国内外の公私立の教育機関・非営利研究機関・研究センター・国立研究所（またはこれに相当する組織）が応募でき、いずれも間接経費上限20%に従うこと。中国（香港を含む）の機関には資金提供を行わない。サイモンズ財団（Flatiron Instituteを含む）からW-2を受け取る職員はPIとして応募できない。2027年1月に終了する現行SRM助成の採択者は応募できるが、2028年6月に終了する助成のPI・co-Iは応募できない。
公式ページに「PIs and co-Investigators (co-Is) must hold a tenured or tenure-track faculty, or equivalent, position at said institutions or centers at the time of application and for the duration of the award.」と定められ、研究代表者と共同研究者は申請時から助成期間を通じて終身在職権を持つ職またはテニュアトラックの教員職もしくは同等の職にある必要がある。非常勤の教員は対象外。応募機関については「Applications may be submitted by established U.S. and foreign public and private educational institutions and stand-alone research centers.」と明記され、米国外の公立私立の教育機関および独立した研究機関も応募できるため、日本の大学や研究機関に所属する研究者も対象になる。国籍要件はない。米国の国立研究所への助成は認められず、営利機関は対象外。「SF and SFI do not provide funding to institutions in China (including institutions in Hong Kong), or to fiscal sponsors or agents of institutions in China or Hong Kong.」として中国および香港の機関とその資金の受け皿となる団体や代理人への助成は行わない。サイモンズ財団のW-2従業員（Flatiron Institute の職員を含む）は研究代表者になれず、個人としての資金も受け取れない。応募はまず意向表明書を提出し、通過後に本申請を提出する二段階方式。
Applications may be submitted by established U.S. and foreign public and private educational and nonprofit institutes and research centers. 特定大学の教員の研究の拠点になっているにすぎない研究所・センターは対象外。実験を主目的とする国立研究所（またはこれに相当する組織）は対象外。物理的な拠点を持たない取組・コンソーシアム・組織も対象外。中国の機関、およびその資金の受け皿となる団体・代理人への資金提供は行わない（中国の機関への再委託や中国の機関で働くコンサルタントへの資金も含む）。サイモンズ財団（Flatiron Instituteを含む）からW-2を受け取る職員はPIとして応募できない。
Institutional involvement and approval are not required for the application, and applicants from within or outside the United States are eligible. 応募はシンポジウムの組織委員会のメンバーが行う。組織委員会は分野を牽引する2〜4名で構成する。